BA.4, BA.5, XD, XE… des sous-lignages d’omicron ou bien de variants « recombinants » (issus d’une combinaison entre deux souches différentes) ont été détectés dans plusieurs pays dès le début de l’année. Quelle est leur diffusion aujourd’hui, dans le monde, et notamment en France ? Quelles différences par rapport au variant omicron ? Le point sur les dernières données disponibles.

Sous-lignages BA.4 et BA.5

Deux nouveaux sous-variants de la lignée omicron, BA.4 et BA.5, classés « variants d’intérêt » par l’OMS, ont été détectés pour la première fois en Afrique du Sud en janvier-février 2022. Fin avril, quelques centaines de séquences avaient été soumises à la base de données globale Gisaid, provenant aussi du Botswana, du Danemark, de l’Angleterre et de l’Écosse. BA.4 et BA.5 sont assez similaires à BA.2, mais leur protéine Spike possède en plus les mutations d’intérêt L452R et F486V, dont la première est une source potentielle d’inquiétude (elle a été décrite comme l’un des facteurs associés à la transmissibilité importante du variant delta).

Variants recombinants

Recombinants de BA.1 et BA.2

XD (« deltacron »)

Pour conclure

Pour en savoir plus
Santé publique France. Coronavirus : circulation des variants du SARS-CoV-2. 22 avril 2022.
UK Health Security Agency. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England. Technical briefing 41. 6 mai 2022.
UK Health Security Agency. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England. Technical briefing 40. 8 avril 2022.
Simon-Lorière E, Montagutelli X, Lemoine F, et al. Rapid characterization of a Delta-Omicron SARS-CoV-2 recombinant detected in Europe. Research Square (preprint) 4 avril 2022.
Gozlan M. Omicron : ce que l’on sait des sous-variants BA.4 et BA.5. Le Monde - Réalités biomédicales, 30 avril 2022.

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