Pris le plus souvent per os, le MTX peut aussi être injecté par voie sous-cutanée (SC). Son absorption intestinale est saturable et dépend du pH.2, 3 Sa biodisponibilité par voie orale varie selon les sujets de 30 à 90 %. Il est lié à 50 % aux protéines plasmatiques et subit un métabolisme hépatique avec conversion en 7-hydroxyméthotrexate. Son élimination est essentiellement rénale et sa demi-vie plasmatique varie de 4 à 10 heures. Dans les cellules cibles, il est transformé en polyglutamates de MTX, métabolites actifs qui s’accumulent, expliquant son efficacité prolongée. Avec la voie SC, environ 17 fois plus coûteuse que la forme orale, la molécule a une biodisponibilité accrue, surtout pour des doses supérieures à 15 mg/semaine.